La conservación preventiva tiene por finalidad tomar una serie de medidas preventivas para minimizar los posibles deterioros de las obras, causados por el propio envejecimiento de los materiales con el paso del tiempo o por factores exteriores como la manipulación de las obras y, de ese modo, evitar futuros tratamientos de restauración más delicados.

La conservación preventiva incluye un programa de mantenimiento y de conservación para los objetos y montajes dalinianos de cada vitrina, espacio y sala de los cuatro museos, como la limpieza, las intervenciones puntuales de consolidación o la proyección de restauraciones más importantes. Dalí concibió el Teatro-Museo como una gran instalación, como una serie de montajes relacionados, que van desde el Cadillac con lluvia en su interior, hasta la sala-rostro de Mae West, pasando por los disfraces venecianos, las puertas con alpargatas o la momia de una princesa china recubierta de microchips y el cabezudo de cartón; si este planteamiento de conjunto representa un elemento distintivo para el museo, al mismo tiempo es uno de los mayores retos para los conservadores de la obra daliniana, dada la diversidad y heterodoxia de los materiales utilizados.

Además, la singularidad de los espacios arquitectónicos y museísticos que gestiona la Fundación   – el antiguo teatro de Figueres o los espacios reducidos de las casas de pescadores de Portlligat - hace particularmente complejo algún aspecto de la conservación preventiva. Ello comporta el desarrollo de estrategias y de soluciones particulares para cada caso. Los trabajos de conservación preventiva también incluyen el control y el seguimiento de la temperatura, la humedad y la luz de las salas y de las áreas de almacén, para que se mantengan estables, en los niveles convenientes para la conservación de las obras.